Lorsque les glaces ont commencé à fondre à la fin de la dernière période glaciaire, il y a environ 10 000 à 15 000 ans, le niveau des mers a remonté, ce qui a inondé la majeure partie du plateau de la Sonde et fragmenté le Sundaland en l'archipel et la péninsule que nous connaissons aujourd'hui. Les mers peu profondes qui couvrent maintenant le plateau sont la mer de Chine Méridionale (partie sud), le détroit de Malacca, la mer de Java et la mer de la Sonde.

Cette histoire géologique a eu un impact immense sur la biodiversité de la région. Le Sundaland est considéré comme l'un des points chauds de biodiversité les plus riches et les plus menacés de la planète. La présence d'une vaste masse terrestre continue pendant de longues périodes a permis aux espèces végétales et animales de se disperser largement et d'évoluer dans un grand écosystème interconnecté. Lorsque la montée des eaux a séparé les îles, les populations se sont retrouvées isolées, ce qui a favorisé l'évolution indépendante et conduit à des taux élevés d'endémisme. On y trouve une faune emblématique , qui comprend votamment les orangs-outans (deux espèces distinctes, l'une à Bornéo et l'autre à Sumatra), les tigres de Sumatra, les rhinocéros de Sumatra et de Java (parmi les mammifères les plus menacés au monde), le tapir de Malaisie, l'éléphant pygmée de Bornéo, ainsi qu'une incroyable diversité d'oiseaux, de reptiles, d'amphibiens, de poissons d'eau douce et une flore exceptionnellement riche, notamment des forêts tropicales humides parmi les plus anciennes et les plus complexes du monde.

Sur le plan anthropologique, le Sundaland a joué un rôle essentiel dans l'histoire des migrations humaines. Pendant les périodes de bas niveau marin, il a formé une partie importante de la route terrestre ou semi-terrestre empruntée par les premiers Homo sapiens lors de leur expansion hors d'Afrique et d'Asie continentale, notamment pour atteindre les supercontinents aujourd'hui disparus du Sahul (Australie-Nouvelle Guinée) et de la Wallacea. De nombreux sites archéologiques témoignent d'une présence humaine ancienne dans la région. Aujourd'hui, le Sundaland abrite une grande diversité de groupes ethnolinguistiques, de cultures et de langues, qui reflétent de longues histoires de peuplement et d'interactions.

Cependant, malgré sa richesse naturelle et culturelle exceptionnelle, le Sundaland fait face à des menaces écologiques d'une gravité extrême et d'une rapidité alarmante. La déforestation massive pour l'expansion de l'agriculture (en particulier les plantations d'huile de palme, de caoutchouc et d'autres cultures), l'exploitation forestière légale et illégale, le développement des infrastructures, la croissance démographique et les incendies de forêt (souvent liés au défrichement) détruisent les habitats naturels à un rythme sans précédent. Le braconnage et le commerce illégal d'espèces sauvages poussent de nombreuses espèces endémiques au bord de l'extinction. La pollution et les impacts du changement climatique aggravent également la situation. La conservation du Sundaland est donc une priorité mondiale, non seulement pour préserver sa biodiversité unique, mais aussi pour le rôle de ses forêts dans la régulation du climat et pour leur valeur intrinsèque.