• La recombinaison homologue. - Ce type de recombinaison se produit pendant la méiose, un processus de division cellulaire spécialisé qui conduit à la formation de gamètes (ovules et spermatozoïdes) chez les organismes sexués. Pendant la méiose, des segments homologues de chromosomes parentaux s'associent et échangent des fragments d'ADN par un processus appelé crossing-over. Cela entraîne la réorganisation des allèles sur les chromosomes, créant de nouvelles combinaisons d'allèles dans les gamètes produits.

• La recombinaison non homologue. -  Ce type de recombinaison implique des échanges d'ADN entre des régions non homologues des chromosomes. Contrairement à la recombinaison homologue qui se produit naturellement pendant la méiose, la recombinaison non homologue peut être induite expérimentalement en laboratoire. Elle est souvent utilisée dans la génétique moléculaire pour modifier des séquences d'ADN de manière ciblée, par exemple pour insérer ou éliminer des gènes spécifiques.

La fréquence de recombinaison.
La fréquence de recombinaison est une mesure statistique qui indique la probabilité qu'un crossing-over se produise entre deux gènes spécifiques sur un chromosome. Elle est exprimée en pourcentage ou en unités de centi-Morgan (cM), où 1 cM correspond à une probabilité de 1 % de recombinaison entre deux gènes. Une fréquence de recombinaison élevée entre deux gènes suggère qu'ils sont situés loin l'un de l'autre sur le chromosome, tandis qu'une faible fréquence indique une proximité relative.

La fréquence de recombinaison est déterminée expérimentalement en étudiant les descendants issus de croisements entre individus porteurs de différentes combinaisons d'allèles pour plusieurs gènes. Par exemple, en croisant des plantes révélatrices pour deux gènes situés sur le même chromosome, on peut observer les proportions de phénotypes recombinants et non recombinants dans la génération descendante. En comparant ces proportions aux prédictions de la loi de l'indépendance des traits, on peut calculer la fréquence de recombinaison entre les deux gènes.

Cette fréquence est également influencée par divers facteurs, tels que la distance entre les gènes sur le chromosome, les contraintes structurelles du chromosome, et les mécanismes moléculaires impliqués dans le crossing-over. Des zones où le crossing-over est rarement observé sont appelées régions de suppression de la recombinaison, tandis que des régions où il est fréquent sont appelées régions de promotion de la recombinaison.